In 1833 Henle went to Berlin and received his state certification.
The following year he became Prosector at the „Medizinisch-Chirurgischen Militär-Akademie“ (Surgical Military Academy) and in spring of 1840 he became the first anatomist in the newly founded University of Zurich.
Disputes at the University led to his transfer to Heidelberg, where he taught beside Friedrich Tiedemann, but the two famous teachers‘ personalities clashed.
www.ub.uni-heidelberg.deZum Staatsexamen wechselte er 1833 nach Berlin, und im darauf folgenden Jahr nahm er dort eine Stelle als Prosektor an der Medizinisch-Chirurgischen Militär-Akademie an.
Er habilitierte sich 1837 („Symbolae ad anatomiam villorum intestinalium inprimis eorum epithelii et vasorum lacteorum“).Im Frühjahr 1840 wurde er zum Professor und Direktor des anatomischen Institutes an der neu gegründeten Universität Zürich berufen.
Querelen an dieser Universität veranlassten ihn, 1844 einen Ruf der Universität Heidelberg anzunehmen, wo er zunächst neben Tiedemann unterrichtete.
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