Mit bindungsbasierten Technologien werden viele Proteine lokalisiert und identifiziert ( „ Affinity proteomics “ ).
Das EU Projekt zielt auf die Vermeidung von Engpässen bei der Produktion von spezifischen Affinitätsreagenzien unterschiedlichster Art (Antikörperfragmente, DARPins , DNA Aptamere) für verschiedene Anwendungen der funktionellen Proteomforschung (Proteinchips, Fänger-Microarrays, Fluoreszenztechniken, Einzelmolekül-Detektion, intracellular knockdown, etc.).
Der Fokus der Binder-Produktion und Analyse liegt auf den Proteinen der TGF-beta und MAP Kinase Signalwege, die in vielen Krankheiten eine Rolle spielen.
www.biaffin.comThe collaborative research project between 5 leading academic groups and 6 commercial enterprises called AffinityProteome has been established to develop tools and technologies for proteome research based on affinity reagents enabling the detection and localisation of multiple proteins through the application of binder-based technologies ( affinity proteomics ).
This project focuses on resolving bottlenecks in the production of specific affinity reagents of different types (antibody fragments, DARPins, DNA aptamers) to be used in advanced applications (protein chips, capture microarrays, fluorescence imaging, single molecule detection, intracellular knockdown).
The targets for binder production and analysis are the proteins of the TGF-beta and MAP kinase signal transduction pathways implicated in many diseases.
www.biaffin.comNGFN-PLUS
Funktionelle Hochdurchsatz-Untersuchung von Genen und Signalwegen, die mit humanen Herzinsuffizienzphänotypen assoziiert sind, mittels Morpholino Knockdown-Analysen im Zebrafisch
Leitung:
www.ngfn.deNGFN-PLUS
High-throughput functional in vivo evaluation of heart failure associated genes and pathways by Morpholino knock-down in zebrafish
Coordinator:
www.ngfn.deDie funktionale Charakterisierung wird auf drei Ebenen durchgeführt :
1. Knockdown von Proteinkandidaten in existierenden und neu zu entwickelnden Assays zur Charakterisierung phänotypischer Konsequenzen.
2. Bestimmung des Proteinkomplexaufbaus durch konsekutive Knockdowns in Reporterzelllinien der generierten Proteinkomplexkomponenten.
www.ngfn.deThe functional characterization will be performed on three levels :
1.Knockdown of candidate proteins applying existing and novel assays to characterize phenotypic consequences.
2.
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